Усилившийся феодальный гнет и тяжелые налоги вызвали резкий протест со стороны крестьянства.
Началось массовое бегство крестьян на окраины государства - Дон, Волгу, Урал.
На окраинах, где государство не имело достаточно развитого административного аппарата, бежавшие крестьяне, солдаты, стрельцы могли еще укрыться от кабалы помещиков.
Вскоре бегство на окраины приняло такие размеры, что московское правительство приступило к решительной борьбе с ним. Это вызвало массовые крестьянские восстания.
Первым вспыхнуло восстание в Астрахани. Толчком для него послужили чрезмерные поборы и произвол воеводы Ржевского.
Против царского правительства восстала не только масса скопившегося в торговой и промышленной Астрахани беглого люда, но и астраханское купечество, обираемое алчным воеводой. Примкнули к восстанию солдаты и стрельцы астраханского гарнизона.
Воевода Ржевский и с ним до 300 начальных людей - офицеров, чиновников, иноземцев - были перебиты восставшими.
Восстание начало быстро распространяться по Нижней Волге, по р. Урал и даже перебросилось на р. Терек. О серьезности восстания в Астрахани говорит и тот факт, что Петр направил на его подавление одного из лучших военачальников своей армии - фельдмаршала Шереметева.
Вскоре Шереметев осадил Астрахань. Среди осажденных не было единства. Астраханское купечество и духовенство боялось восставших бедняков больше, чем царских воевод и гнева Петра. Оно изъявило полную покорность. Измена купечества помогла Шереметеву подавить восстание. В марте 1706 г. Астрахань сдалась. Восстание было разгромлено и потоплено в крови.
Средний и Нижний Дон издавна являлся районом, куда бежали крепостные крестьяне, спасаясь от помещичьего гнета и произвола. Обычно беглецы селились в "верховых городках" по Среднему Дону и его притокам. Низовые, "матерые", хозяйственные казаки - верные слуги царского правительства - сами были заинтересованы в притоке беглецов, которых они эксплуатировали в своем хозяйстве. Установился обычай не выдавать с Дона беглых. Сейчас, со взятием Азова, с постройкой крепости Таганрог, с появлением правительственных войск на Дону, былые привилегии казаков становились все более нереальными.
Петр требовал от донских казаков участия во всех войнах. Уже много казачьих костей белело на равнинах Прибалтики и Польши. Это вызывало недовольство среди низового зажиточного казачества.
После подавления астраханского восстания правительство направило в "верховые городки" военные отряды для поимки беглых крестьян и возвращения их помещикам. Тысячи беглых крестьян были захвачены правительственными отрядами и угнаны на север. Весь Верхний Дон заволновался и восстал. Почти все карательные отряды были уничтожены. Во главе восстания встал казак Трехизбянской станицы Кондратий Булавин. Восстание быстро распространилось на всю территорию донского казачьего войска. Восставшие захватили город Черкасск. Булавин был избран атаманом "Всевеликого Войска Донского". Весной 1708 г. отряды донских казаков вместе с казачьей беднотой Запорожья и беглыми крестьянами двинулись за пределы войсковой территории.
Большой отряд повстанцев направился на р. Северный Донец поднимать на восстание слободских казаков; другой отряд пошел на Воронеж, рассчитывая на присоединение к восставшим рабочих воронежских верфей; двинулись отряды и на Волгу.
Восстание захватило большой район и грозило распространиться на весь юг.
Сам Булавин попытался захватить крепости Азов и Таганрог.
Правительство направило на Дон крупные силы для подавления восстания. Булавин потерпел неудачу под стенами Азова, и низовое зажиточное казачество немедленно этим воспользовалось. Булавин был окружен в своем доме заговорщиками - богатыми казаками и после отчаянного сопротивления застрелился. Слободские казаки не только не примкнули к восставшим, но и помогли правительственным войскам подавить восстание.
Вскоре все казацкие отряды были разгромлены и восстание потоплено в крови. Остатки разбитых повстанцев во главе с атаманом Некрасовым ушли в Турцию.
Булавинское восстание имело в России несравненно больший отклик, чем Астраханское. Стихийные крестьянские восстания прокатились по всему югу страны и Поволжью, охватив 43 уезда. Однако все они не имели единого руководящего центра, носили стихийный, местный характер и были легко подавлены правительством.
Одновременно с этими двумя большими восстаниями происходило восстание башкирского народа, затянувшееся на целых шесть лет - с 1705 г. по 1711 г.
Башкиры восстали из-за непосильных государственных налогов и насилий со стороны царской администрации. Кроме того, для строящихся заводов на Урале у башкир отбирали лучшие земли и леса; их принуждали выполнять тяжелые подсобные работы.
Башкирской восстание вначале возглавляли феодалы. Они делали ставку на отделение Башкирии от России и превращение ее в самостоятельное государство под покровительством Турции. Но вскоре восстание охватило казанских татар, мари, чувашей и удмуртов. Оно подняло на борьбу широкие массы населения и грозило смести и самих башкирских феодалов. Напуганные широтой и силой движения, феодалы стали просить помощи у русского правительства. Измена башкирских феодалов своему народу облегчила разгром восстания. Вскоре восстание было подавлено.
Характерно, что народные восстания в петровский период в основном проходили в первые десять лет Северной войны, когда Петр требовал от страны особенно большого напряжения. Все тяготы, связанные с войной и реформами, ложились на плечи народа, с которого "драли три шкуры".
Все эти восстания были направлены против феодального гнета. Они расшатывали устои феодально-крепостнической системы.
Восстания крестьян не могли победить, потому что не было еще рабочего класса, который мог бы возглавить и организовать их.